8月15日，日军大本营下令成立以松井石根大将为司令官的上海派遣军。
后因上海战事胶着相持不下，日军大本营于10月21日组建了以柳川平助中将为司令官的第十军，井于11月5日在杭州湾北岸登陆，包抄上海战区。
日军大奉营下令成立以松井石根大将为司令官的华中方面军，以统一指挥日军上海派遣军和日军第十军。
1938年2月18日，日军大本营为准备进攻武汉成立了以烟俊六大将任司令官的华中派遣军，并下令解散华中方面军及上海派遣军、第十军，改由华中派遣军统一指挥占领京沪杭、苏、浙、皖的全部华中日军。
1938年6月起，日军华中派遣军指挥第二军、第十一军沿长江两岸及大别山区进攻武汉。
1938年10月25日日军侵占武汉后，以冈村宁次中将为司令官的第十一军的7个师团占据武汉外围鄂、湘等省的部分地区。
1939年9月23日，日军大本营为统一指挥在中国关内各地的日军，配合汪精卫筹建伪政权的活动，在南京成立了以西尾寿造大将为司令官的日军中国派遣军司令部，统一指挥日军华北方面军及所有在中国关内战场的部队。
与此同时，日军华中派遣军撤销，在江浙地区成立了军司令部设在上海的以酉尾寿造大将兼任司令官的第十三军。
1944年7月31日，日军大本营为准备“一号作战“华中攻势，又在湖南成立自日本关东军调来番号的第二十军；
并在武汉成立第六方面军，统一指挥两湖地区的第十一军和第二十军，在汉口留守的第三十四军和两广地区的第二十三军及香港占领地日军，以准备参加'一号作战“中的湘桂战役。
至1945年夏，日军第六方面军管辖第十一军、第二十军、第三十四军，控制中国鄂、湘、皖、赣等部分地区。
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