他顺利带领火箭进入季后赛，并首轮淘汰波特兰开拓者队，火箭队在时隔多年后再次进入季后赛第二轮。
值得一提的是，姚明在首轮对阵开拓者队的第一场中，上半场24分钟内，9投9中，6罚6中得到24分和9个篮板。
不过在第二轮对战洛杉矶湖人队的比赛中，姚明因脚伤导致休战，甚至影响了2009-10赛季。
2009年1月18日，对阵热火12投12中拿到26分。
2009年3月14日，对阵山猫投中赛季第1个3分。
2009年4月19日，对阵开拓者姚明在24分钟内9投9中得到24分。
5月5日，对阵湖人的西部半决赛第一场中受伤，但经过调整后执意冲回赛场，并最终带领火箭取得胜利。
5月10日，左脚骨裂，该赛季报销。7月，他成为上海大鲨鱼俱乐部老板。
2010年11月11日，伤愈复出不久的姚明在同奇才队的比赛中再度受伤，随后一直休战。
12月18日，火箭官方宣布姚明左脚踝第三次应力性骨折，赛季报销。
2015年12月21日，火箭队正式提名姚明入选2016年的篮球名人堂。
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