全军将士拥载吴捷，而左七军也在某种程度上成了吴捷的私家军。
吴捷曾和罗大纲私议太平军“三大弊”，其中一大弊端是军中山头林立。即便是军师杨秀清，也只能在名义上统管全军。诸如军中的人事，多由一军总制奏明东王，由东王批准。
太平军山头林立，就算是早期广西老兄弟，也有很多派系。根据隶属关系，可以分为东殿、北殿、翼殿等；根据籍贯不同，可以分为贵县帮、桂平帮、博白帮、浔州邦等；根据职业不同，可以分为矿工帮、水寇帮、客家帮等……
洪秀全以拜上帝会团结全军，杨秀清以严苛的军纪控制全军，实际并不能真正统一全军。
如今战事频繁，军头们在前线死战。战后，军头们自恃立有战功，奏请杨秀清论功行赏、提拔属下。就算杨秀清能代“天父下凡”，也必须照顾军头们的面子，不能过多干预军中人事。
后世常常感叹，杨秀清权势盖过洪秀全，竟斗不过手无一兵一卒的洪秀全。天京事变时，洪秀全一纸诏令，就召来千军万马，将杨秀清乱刀砍死。
一方面，这固然是因为杨秀清性格孤傲，得罪的人太多。另一方面，也在于太平军中军头林立，即便他是军师，也并不能彻底掌控全军。
一支成熟的军队，必须要完善组织架构，建立集中统一的指挥领导体制。
清军绿营各不隶属，败不相救，胜则相争。这是太平军能屡败清军绿营的重要原因。
湘军以落魄书生为军官，以同乡农民为士卒，加以军纪严明，军饷丰厚，最终打败太平军。
列强凭职业军官、先进武器，将清军打得落花流水。
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