相比之下，太祖对佛教的整顿，却有《申明佛教榜册》。
显然，太祖对佛教的约束比道教更为严厉，而他整倾宗教的目标主要是针对佛教。
明太祖对道教相当重视，并采取了些鼓励的措施。
大明建国以后，他赐建了不少道教宫观，以示对道教的尊崇。
他深知，这些道家者流所做的都是一些清净之事，于国极为有利，而且围家的祭祀大典也都“用以执事”，理应“有以居之”。
在洪武十二年二月，他下令在郊祀坛两边建成神乐观，作为道士的居住地。洪武十七年，在南京永寿宫的旧基上，重新建成一座道教官观，赐名“朝天宫”，并在内设立了道录司。
洪武二十一年，金陵的“北极玄天真武祠“因灾而毁。
明太祖下令，将此祠改建于饮山之阳，至第二年祠成。修成后，又命宋讷“为文记于石”。
洪武年间，太祖还下令在都城内卢龙山上建卢龙观，并救赐观额。在洪武年间，太祖多次派遗官员或道士到泰山致系。
洪武十年，遗曹国公李文忠及道士吴永舆、邓子方致祭于泰山东岳之神；洪武二十六年，又派神乐观道士乐本然、国子监生王济到泰山致祭。
最值得一提的是，在洪武七年，明太祖亲自注疏了道教的经典《道德经》，显示出他对道教的礼敬。
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