扶桑臣民得在中国通商口岸城市任便从事各项工艺制造，将各项机器任便装运进口，其产品免征一切杂税，享有在内地设栈存货的便利。
扶桑军队暂行占领威海卫，由满清政府每年付占领费库平银二十万两，在未经交清末次赔款之前，扶桑不撤退占领军。
本约批准互换之后，两国将战俘尽数交还，满清政府不得处分战俘中的降敌分子，立即释放在押的为扶桑军队效劳的间谍分子，并一概赦免在战争中为扶桑军队服务的汉奸分子，免予追究。
虽然通过一系列的暗中策划，《马关条约》赔款从2亿两白银降低到6000万两白银，少开放了重庆和苏州两个口岸，但是它依然是清朝签订最严重的不平等条约，给近代华夏社会带来严重危害，东北三省，台湾等大片领土的割让，进一步破坏了华夏主权的完整，刺激了列强瓜分满清的野心，民族危机进一步加深。
千万别以为《马关条约》签定战争就结束了，戏肉还在后面。
《马关条约》签订6天后，俄罗斯帝国因扶桑占领辽东半岛，阻碍它向满清东北伸张势力，便联合法、德两国进行干涉。
第七天，大洋王国与法国因为扶桑国割让台湾，澎湖，严重侵犯了其利益，便联和俄德干预。
1895年5月31日
扶桑宣布放弃辽东半岛，但要满清以白银1000万两将其“赎回”。
扶桑宣布放弃台湾，澎湖，要满清以白银300万两将其“赎回”。
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