藏经阁分为三层楼，楼上通为一间，楼下分为五间，取“金木水火土”，药王谷的弟子可在特殊的日子前来观看经书，或者持有楼主的手令，寻常弟子便可在一楼随便翻阅经书，一概不得带出。
二楼只能修行登上六层楼的药王谷弟子或者特例的弟子才有资格进入，比如药逸尘便因为修行长生诀，就可进入二楼。
三楼只有谷主和几位长老楼主才能进入。
藏经阁园林布局，十分精致，周围分别有着剑林，龙兰阵，水池，火炉，五色土。
藏经阁乃是药王谷的心脏，也是药王一脉渊源传承的重要所在，所以至关重要，非药王谷弟子不能入内。
剑林里面插满了残剑废器，多是药王谷已故弟子的佩剑，夹杂着许多来历不明之人想要闯入藏经阁而丧身于此。
龙兰阵便是藏经阁前一排排的龙兰，远远望去就像是五条沉睡的巨龙，一旦有外敌闯入，便可用被阵眼唤醒。传闻藏经阁便是一朵修行千年的龙兰，当年被药王祖师所救，便生根在药王谷，用自己的一瓣花朵化身藏经阁，守护着药王谷。
水池暗通药泉，每每在月圆之夜，可看到冰火鱼在其中游动，甚是奇观，用水池里的水来炼药，品质要比用药泉练出的高上些许，只是不得谷主允许，这里的水是万万不可动的。但也有例外，直到药逸尘假装掉入水池，喝上一口发现异常的苦涩难咽，才知道原来这水池乃是龙兰日积月累的体液。
火炉乃是一处地底喷射而出的地火，蕴含了极大的火灵，经年不衰，观火楼的弟子十分喜爱，可不得到火半闲的允许，是不可以来此修炼自己的本命武器。
五色土便极为宝贵，上面种满了极其宝贵的奇花异草，除了谷主其他人一概不得靠近。最为神奇的地方就是五色土一旦离开原地，便于普通土壤没有区别，这也让一直对五色土念念不忘的药逸尘和李相思颇为抱怨，两人就算想偷也偷不走。
藏经阁前的管事长老药不语精神矍铄，年级似乎比药思仁还要大，每次看到药逸尘都笑眯眯的，看到李相思则假装没看到。
当然没有什么是一条冰火鱼解决不了的，这也就是为何李相思和药逸尘能够闯进剑林，偷五色土的原因，不过说来也奇怪，五行大阵从来没有主动伤害过两人，药不语也就睁一只眼闭一只眼。
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