1937年全面抗战爆发后，朱赤时任第88师262旅团长，听闻消息，发誓要以生命报效国家，加紧训练部队，同时经常对将士们进行爱国教育，以激发官兵们的爱国热情。并且屡次请战效命。
1937年8月上旬，日军在上海制造事端，蓄意挑起战争。第88师是当时中国陆军的精锐主力，88师奉命开赴上海，准备应战。这时，朱赤升任262旅少将旅长。8月12日，朱赤率部向上海开进，于次日到达真如待命。到达防守区后，朱赤发现有的士兵上街看热闹，有轻敌思想，立即召开团营军官会议，命令全体官兵：一、坚守战斗岗位，不许上街；二、熟悉了解地形，掌握日军动态；三、推迟两小时吃晚饭，抢修加固防守工事。此时，日军加紧向上海集结兵力，战事一触即发。朱赤奉命率262旅迅速向闸北推进，占领北火车站，字桥、江湾一线。
字桥是两次淞沪战役的引火点，战略位置十分重要。13日，会战正式展开，朱赤率部在字桥等地首战日军。15日，向日海军司令部.发起猛攻，在264旅的协同下，终于占领日海军司令部。
8月下句，日军增援部队陆续抵达上海，凭借其装备精良，训练有素，人数众多的优势，很快占领了罗店，吴淞等地。262旅被迫由进攻转入防御，退至苏州河岸和江湾之间，以闸北为抽心阵地，构筑街市防御体系。日军多次进攻闸北阵地，均遭失败。
淞沪会战是抗战初期的最残酷的战役之一，双方几十万大军聚集在狭小的地区拼死争斗，反复争夺。朱赤将军和广大抗战将士们，冒着敌人猛烈地进攻，多次打退了敌军的进攻。鼓舞了全国抗战军民的信心，同时也赢得了国际舆论对中国的支持。成功粉碎了日军妄图“二十四小时内占领上海”的狂妄野心。到了11月初，我军伤亡过大，为抗战大局计，我军撤出上海一线，淞沪会战失利。
南京捐躯传千古：
11月初，日军在杭州湾登陆，进攻上海中国守军侧背、形成包围之势，朱赤奉命率部撤退，向吴福线和锡澄线既设防御阵地转进。但由于既设阵地上没有留守部队，也没有向导人员，军队进入时无法疏散，乱作一团。262旅立足末稳，日军追踪而来，迅速突破既设阵地。朱赤率部退往南京，参加南京保卫战。
敌军步步进逼南京，形势危急。南京为当时的国民政府首都，地理位置重要，更有重要的象征意义，不容有失。日军亦知南京的重要意义，势必拿下南京，逼迫国民政府屈服。军事当局决定在南京与敌血战到底，以鼓舞全国军民的士气。
南京卫戍司令长官唐生智令十师担任腹廓阵地的防御，朱赤旅守卫雨花台。朱赤将军亲自视察阵地，教育士兵宁为战死鬼、不作亡国奴，鼓励士兵们奋勇杀敌，誓死与首都南京共存亡。
12月初开始，日军主力十余万人开始疯狂进攻南京的外围我守军阵地，日军分兵三路进迫南京，取包围之势。第六师团为西路，经宣城进攻芜湖，企图截断南京守军的退路。敌军由于在先前战斗中进攻虽多次得手，但由于抗战军民的英勇抵抗，敌每次进攻都付出了惨重的代价。为了迅速拿下南京，日军集中火力，猛烈进攻，我守军各部经淞沪会战后未经修整便立即投入南京保卫战，战斗力减弱。外围阵地经过激战后，多沦于敌手，情况危急。
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