坂井悠二是个平凡的高中一年级学生。升入二中的高中部后。。除了与初中好友有幸再次同窗这一小小的惊喜外，再也没有什么特殊的地方。
这位平凡的高一生，和同学们一样，早就过了把超人之类奉为偶像的年龄。他并不完全否认鬼神之类的超自然现象存在的可能性，但也仅止于此。
就算世界上真的有魔法，那有和他有什么关系呢？接触不到，就代表不会对生活产生影响。与其探求不可捉摸的神秘现象，还不如把心思放在学习上，既对父母、也是对自己负责。
但这并不代表悠二缺少这个年龄少年应有的好奇心与探索欲望，否则他就不会选择在深夜来到这栋早已无人居住的荒废宅院。
这座典型的日式宅邸。。据说曾属于学园岛的某个高层人士。在原本的所有者离开后，好像又入住了神秘的外来者。之所以说是神秘，因为听说那位外来者一不是任何一间学校的职工，二并非哪位学生的家属。单是他能够以非相关者的身份呆在岛上而没有被驱逐，就已经是个附近邻里间热衷的话题。
有人猜测那位外来者是学园都市内部势力聘请的研究人员，在这座隐蔽的宅邸中从事学园都市官方禁止的研究。
这样的猜测并非毫无根据的臆想。
理由之一，十年前的某个夜晚后，那名外来者毫无征兆地突然消失。事后有人曾去中央区与麻帆良学园共用的机场调查，结果是找不到一名姓‘卫宫’的男人的离港记录。
学园岛与外界的交通方式，只有飞机与大型货轮两种。货轮，顾名思义是岛内与外界交流物资的途径。别说不供一般人乘坐，事实上货轮只是定期通航，而那名外来者消失的时间，正好并无货轮停泊在港口。
分析后的结论，如果那位外来者确实是离开了学园岛，那么唯一的方法，就是搭乘学园都市内部的航班。
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