随着第44话的刊出，《棋魂》也正式进入了第二阶段。
小光的周围，不再是同学和玩伴，而是像他一样，以职业棋手为目标的学员。在这里，每个人学习围棋的时间都要比小光长，因此，最开始的一段时间，小光输多赢少，直到第47话，他赢过对手的次数，才逐渐多了起来。
《棋魂》之后的小书，也像是过山车一样，在第45话时，降到第7名。
正当王闻弘准备抓狂的时候，《棋魂》的小书名次又在第47话，回到了第5名，变化速度之快，连他都觉得不可思议。
想来想去，应该是沈昕在47话的结尾处，留下了一个悬念——棋王赛冠军座见（座间）和小亮之间的对决。
因为是第一次正式描写职业围棋。所以不少读者，甚至，一些棋手都会对这一话感兴趣。
这一段情节本来属于新初段联赛，即是初入段的棋手与有头衔的棋手，进行倒贴目的比赛。
《棋魂》原著中，比较有名的三场初段赛是座间（王座）对阵塔矢亮，塔矢行洋（十段）对阵进藤光（佐为），以及桑原仁（本因坊）对阵伊角慎一郎。
但这个世界的华夏，职业棋手比较，拥有头衔的棋手不可能和他们一一对弈，便会有一些段位比较高的棋手，对阵初段选手。
为了考虑到故事的精彩程度，这三场对决，沈昕依然选择拥有头衔的棋手。。与三名新进初段对弈，只是，对阵的地方是比较正式的赛场，而不是“幽玄之间”。
他也知道，这样的改动会让画面的气场有所减弱，毕竟不是哪一个赛场，都能达到“幽玄之间”的效果，但这也是无奈之举。
王闻弘也察觉到，在44话之后，沈昕对待《棋魂》name的态度，和之前有了明显的区别，更多时间会琢磨一些比较细节的问题，同时，沈昕也开始和他讨论故事的name。
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